انجام پروژه های بیوانفورماتیکی و طراحی دارو

 

برگزاری دوره های تخصص محور

100

باز کاربرد یابی و ارزیابی دارو

100

شناسایی بیومارکر

100

طراحی دارو

دوره های تخصص محور

تخصص 1

بازکاربرد یابی دارو

دوره تخصصی

Drug Repurposing & ADMET Screening
آیا به دنبال یادگیری  یک  استراتژی خفن برای کشف و توسعه دارو های جدید هستید؟

باز کاربرد یابی دارو یا Drug Repurposing یک روش موثر و نوآورانه است که به شما این امکان را می دهد که اندیکاسیون های جدید برای داروهای موجود را معرفی کنید، بدون نیاز به انجام آزمایشات بالینی طویل و پرهزینه. این روش به شما این امکان را می دهد که به سرعت داروهای جدید را برای بیماری مورد مطالعه خود معرفی کنید و از مزایای آن به کاهش زمان و هزینه توسعه دارو نسبت به روش های سنتی کشف و توسعه دارومی توان اشاره کرد.

 

در این دوره آموزشی که اختصاصا در آکادمی جی جی پلات برگزار می شود، شما با استفاده از پروفایل بیان ژن بیماری، می توانید داروهای موثر را بر اساس شبکه دارو-ژن-بیماری شناسایی کنید. همچنین با یادگیری کد نویسی در پایتون، می توانید خروجی SMILES داروها را بدست آورده و از آنها برای بررسی فارماکوکینتیک و ارزیابی ویژگی های ADMET دارو ها استفاده کنید.

سرفصل‌ های دوره
آشنایی با اصول اولیه و مفاهیم Drug Repurposing

کار با ابزار Clue و Connectivity Map

انجام آنالیز و خروجی گرفتن از لیست داروها

کار با Google Colab

کار با کتابخانه های پایتون

کار با PubChem و Drug Bank

آموزش دانلود فرمت SMILES داروها

کار با Swiss ADME و ADMET Lab

ارزیابی ویژگی های فارماکوکینتیک و  ADMET دارو ها

کار با پایگاه داده Swiss Target

شناسایی تارگت های بالقوه

  • مدت دوره : 4 ساعت
  • بصورت آنلاین و خصوصی
  • برگزارکننده : آکادمی جی جی پلات

تخصص 2

شناسایی بیومارکر

دوره تخصصی

Biomarker Finding by Protein-Protein Interaction Network Analysis
آیا می‌ خواهید بدانید که چگونه با استفاده از آنالیز شبکه پروتئین-پروتئین و ابزارهای بیوانفورماتیکی، بیومارکر شناسایی کنید؟

در دوره شناسایی بیومارکر با استفاده از  آنالیز شبکه پروتئین-پروتئین که توسط آکادمی جی جی پلات برگزار می‌شود با اصول اولیه شبکه، Node و Edge آشنا می‌شوید و مفاهیم مرکزیت در شبکه را فرا خواهید گرفت.

 

همچنین نصب و راه‌اندازی Cytoscape، ایجاد شبکه دارو-پروتئین و بیماری-پروتئین، کار با دیتابیس STRING و خوشه‌بندی شبکه نیز در دوره آموزشی مورد بررسی قرار خواهد گرفت. همچنین با پلاگین‌های MCODE و CytoHubba آشنا شده و پروتئین‌های کلیدی (Hub Genes) را شناسایی خواهید کرد. در پایان، با استفاده از نرم‌افزار FunRich و ترسیم Venn Diagram، بیومارکرها را شناسایی خواهید کرد.

 

مطالب و مهارت هایی که در این دوره به شما آموزش داده می شود، به شما کمک خواهد کرد تا به طور حرفه ای و دقیق تر تحلیل های برهمکنش پروتئین-پروتئین انجام دهید و بیومارکر های مهم را شناسایی کنید. این دوره برای علاقه مندان به زمینه های زیست شناسی و پزشکی بسیار مناسب است.

سرفصل‌ های دوره
 آشنایی با اصول اولیه شبکه و مفاهیم Node و Edge

آشنایی با مفاهیم مرکزیت یا Centrality در شبکه

نصب و راه اندازی Cytoscape

ایجاد شبکه دارو-پروتئین

ایجاد شبکه بیماری-پروتئین

کار با دیتابیس STRING

خوشه بندی شبکه

کار با پلاگین MCODE

کار با پلاگین CytoHubba

شناسایی پروتئین های کلیدی (Hub Genes)

کار با نرم افزار FunRich

ترسیم Venn Diagram

شناسایی بیومارکر ها

  • مدت دوره : 3 ساعت
  • بصورت آنلاین و خصوصی
  • برگزارکننده : آکادمی جی جی پلات

تخصص 3

طراحی دارو

دوره تخصصی

Drug Design by Molecular Docking & LigPlot
اگر به دنبال یادگیری طراحی دارو با استفاده از تکنیک‌های داکینگ مولکولی هستید، این دوره مناسب شماست!

آکادمی جی جی پلات با افتخار دوره‌ای جامع و حرفه‌ای با عنوان "Molecular Docking & LigPlot Plus" را برگزار می‌کند. این دوره شامل آموزش‌های مفصل در زمینه تکنیک‌های مولکولی و نرم‌افزارهای مورد استفاده برای انجام آنالیز می‌باشد.

 

در دوره داکینگ مولکولی و کار با LigPlot Plus با انجام یک پروژه واقعی داکینگ از طریق AutoDock vina و مشاهده نتایج داکینگ از طریق Ligplot Plus آشنا خواهید شد.

 

همچنین، در این دوره با نرم افزارهای Discover Studio ، AutoDock Tools و Open Babel آشنا خواهید شد.  همچنین، در این دوره شما با مفاهیم پایه داکینگ مولکولی مانند تعریف لیگاند، رسپتور، تکنیک‌های پیش‌پردازش مولکولی و تعیین انرژی بین لیگاند و رسپتور آشنا می‌شوید. همچنین در این دوره به بررسی نتایج و تحلیل داده‌های حاصل از داکینگ مولکولی می‌پردازید و با نحوه ارزیابی کیفیت داکینگ مولکولی با استفاده از پارامترهای مختلف آشنا می‌شوید.

 

با اتمام این دوره، شما قادر خواهید بود به طور مستقل پروژه‌های داکینگ مولکولی را انجام داده و نتایج آن‌ را تحلیل کنید.

سرفصل‌ های دوره
 آشنایی با استراتژی های طراحی دارو

آشنایی با داکینگ مولکولی و مفاهیم طراحی دارو ساختار محور

نصب و راه اندازی AutoDock vina

نصب و راه اندازی MGLTools

نصب و راه اندازی LigPlot Plus

نصب و راه اندازی Discovery Studio

نصب و راه اندازی Open Babel

کار با Drug Bank و PubChem

آماده سازی لیگاند شامل اضافه کردن با Gasteiger  و ...

کار با Protein Data Bank (RCSB PDB)

آماده سازی تارگت شامل اضافه کردن بار Kollman و ...

پیش پردازش یا Pre Processing ساختار ها

کار با AutoDock Tools و آشنایی با گرید باکس

ساخت فایل کانفیگ 

اجرای Command  در CMD

دریافت نتایج و کار با Discovery Studio

کار با Ligplot Plus و مصور سازی نتایج

ارزیابی نتایج داکینگ

  • مدت دوره : 3 ساعت
  • بصورت آنلاین و خصوصی
  • برگزارکننده : آکادمی جی جی پلات

جدیدترین مقالات

ما که هستیم؟

آیا به دنبال یک منبع معتبر برای انجام پروژه ها و آنالیزهای بیوانفورماتیکی و هوش مصنوعی و طراحی دارو هستید؟ آکادمی جی جی پلات با تیم متخصص و مجرب خود آماده است تا به شما در این زمینه ها کمک کند. آکادمی جی جی پلات ارائه دهنده خدمات متنوعی از جمله مشاوره پایان نامه، مشاوره پروپوزال، مشاوره مقاله و خدمات دیگر مرتبط با بیوانفورماتیک و هوش مصنوعی است. تیم ما با سابقه درخشان و دانش فنی قوی، به شما کمک می کند تا پروژه های خود را به بهترین شکل انجام دهید. علاوه بر این، آکادمی جی جی پلات دوره های تدریس خصوصی در زمینه های مختلفی از جمله باز کاربد یابی دارو، داکینگ مولکولی، شناسایی بیومارکر، شبکه های پروتئین-پروتئین، شبکه های زیستی و میکرو رنا و ... را نیز ارائه می دهد. این دوره ها به شما کمک می کنند تا مهارت های لازم برای انجام پروژه های بیوانفورماتیکی و طراحی دارو را به دست آورید. با آکادمی جی جی پلات، بهترین منابع و آموزش ها در زمینه های پیشرفته علوم زیستی را در اختیار دارید.