نوشته‌های بلاگ

پایگاه داده بیوانفورماتیکی DAVID (Database for Annotation, Visualization, and Integrated Discovery) یکی از ابزارهای قدرتمند و جامع برای تحلیل داده‌های ژنومیکی، پروتئومی و مرتبط با پروژه‌های تحقیقاتی بیولوژیکی است. این ابزار به پژوهشگران در تفسیر داده‌ها کمک می‌کند تا بینش‌های جدیدی درباره عملکرد ژن‌ها و مسیرهای بیولوژیکی مرتبط با داده‌های خود به دست آورند. در این مقاله، آموزش گام‌به‌گام نحوه استفاده از DAVID به همراه توضیحات تخصصی‌تر ارائه شده است.

ادامه مطلب

پایگاه داده RCSB PDB یا بانک اطلاعات پروتئین مرکز پژوهشی زیست‌شناسی ساختاری، یک منبع باز و دسترسی آزاد است که داده‌های مربوط به ساختارهای سه‌بعدی (3D) ماکرومولکول‌های زیستی مانند پروتئین‌ها، اسیدهای نوکلئیک، کربوهیدرات‌ها و کمپلکس‌های آن‌ها را ذخیره و ارائه می‌کند. این پایگاه داده تحت مدیریت Worldwide Protein Data Bank (wwPDB) قرار دارد و به عنوان مرکز داده‌ای ایالات متحده برای این کنسرسیوم جهانی عمل می‌کند. ساختارهای موجود در این پایگاه داده عمدتاً با استفاده از روش‌های تجربی مانند کریستالوگرافی پرتو ایکس، طیف‌سنجی رزونانس مغناطیسی هسته‌ای (NMR) و میکروسکوپ الکترونی (EM) تعیین می‌شوند.

ادامه مطلب

پایگاه داده STRING (Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins) یکی از جامع‌ترین منابع برای مطالعه تعاملات پروتئین-پروتئین (PPI) است. این پایگاه اطلاعاتی به دانشمندان کمک می‌کند تا شبکه‌های تعاملات پروتئینی را بررسی کرده و از آن‌ها برای کشف عملکردهای زیستی در سیستم‌های پیچیده استفاده کنند.

ادامه مطلب